人體微生物組由定植於不同身體部位的病毒、細菌、原生動物、真菌和蠕蟲等微生物群落構成。 其日益被確認為健康的關鍵決定因素，可提供關鍵營養供給、抑制病原體定植以及調節宿主免疫等益處。 相反，微生物群落組成的異常變化（菌群失調）與營養不良、炎症性腸病、糖尿病、哮喘、焦慮抑鬱等精神疾病及癌症等多種疾病的關聯正不斷擴展。 因此，微生物組已成為新型診斷工具開發的新興靶點，並可通過調控手段發展治療性療法。
將微生物組用於上述目標的主要挑戰在於個體及群體間存在的顯著差異性，該差異由遺傳與環境因素共同驅動。 這種差異表現為分類單元（如存在/缺失、相對及絕對豐度）及其編碼表達功能（如通過菌株變異）的不同。 此類差
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異預計將催生從普適於群體的診斷與療法，到需根據個體定製的個人化方案的完整譜系。 除直接靶向微生物組的療法外，近期研究開始揭示個體微生物組構成與其治療回應能力之間的關聯，凸顯了建立“治療友好型微生物組”策略的迫切需求
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本特刊旨在彙集聚焦微生物組在精準醫療中作用的研究文章，將展示微生物組變異規律、對患者治療回應能力的影響機制及相應作用原理的最新認知。 此外，特刊將重點呈現正在開發的創新方法與策略，包括整合其他組學數據集，以基於個體現有微生物組預測個人化生物標誌物與治療方案。
John Parkinson博士是加拿大多倫多病童醫院高級科學家，同時擔任多倫多大學生物化學與分子遺傳學系教授。 其研究結合計算與基因組學方法，探究微生物對人類健康的影響。 團隊重點解析病原體感染致病機制，應用18S rRNA調查和全微生物組RNA測序（巨集轉錄組學）技術，研究腸道中原生動物微生物的貢獻，尤其關注炎症性腸病與營養不良背景下的作用。