一项大型遗传学研究表明，咖啡的冲泡方式至关重要，过滤咖啡通过改变肠道微生物群来改善血糖控制，而非仅依赖咖啡因。
血糖控制中咖啡作用尚未明确
2型糖尿病(T2D)是一场全球健康危机，当前预测模型估计到2030年患者人数将超过6.43亿。目前的管理干预措施主要依赖监测糖化血红蛋白(HbA1c)，这是一种稳定生物标志物，反映个体过去8至12周内的平均血糖水平。
虽然饮食是已知可调节的干预措施，
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可用于控制HbA1c，但咖啡——世界上最受欢迎的饮料之一——在科学上的作用仍不明确。先前的观察性研究表明咖啡摄入量与糖尿病风险呈负相关；然而，关于咖啡因和胰岛素敏感性的临床试验结果不一，常相互矛盾。
研究人员假设这些差异可能源于咖啡饮用方式的巨大差异（如过滤咖啡与速溶咖啡、黑咖啡与加奶咖啡），以及这些差异如何与肠道微生物组相互作用。近期研究聚焦于肠道细菌产生的短链脂肪酸(SCFAs)，如丙酸，这些物质能提高胰岛素敏感性并降低血糖水平。
连接咖啡习惯与HbA1c的遗传工具
本研究通过调查特定咖啡类型是否通过产丙酸细菌影响HbA1c，弥合了未解假设与微生物组观察之间的知识差距。
研究采用孟德尔随机化(MR)方法，利用遗传变异作为工具变量推断暴露因素（咖啡习惯）与结果（HbA1c水平）间的因果关系，克服了传统观察性研究的局限性（如反向因果关系）。
数据主要来自英国生物样本库的大规模全基因组关联研究(GWAS)，该库包含约50万名欧洲血统参与者的遗传和健康信息。仅纳入与此分析相关的特征——咖啡偏好和HbA1c。
肠道微生物群遗传数据源自MiBioGen联盟，涵盖超18,000名参与者。研究分析了六种咖啡饮用模式：过滤咖啡、含咖啡因咖啡、添加牛奶、糖或人工甜味剂的咖啡，以及速溶咖啡加牛奶。
这些模式与四种产丙酸肠道细菌属进行评估：阿克曼菌属、双歧杆菌属、副拟杆菌属和韦荣球菌属。主要分析方法包括逆方差加权(IVW)建模和中介分析。
过滤咖啡显示出独特的保护信号
在测试的六种咖啡习惯中，仅过滤咖啡显示出与降低HbA1c有统计学显著的因果关联（比值比=0.97，95%置信区间：0.94-0.99，P=0.04）。添加糖、人工甜味剂、牛奶的咖啡或速溶咖啡制备均无保护作用。
微生物组分析证实，所有四种产丙酸细菌（阿克曼菌
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过滤咖啡摄入量在遗传上与韦荣球菌属丰度增加相关（P<0.01），而后者又与较低的HbA1c相关（P<0.01）。中介分析发现，韦荣球菌属解释了过滤咖啡血糖益处的43.33%。
相反，添加糖与韦荣球菌属呈边缘显著的负相关（P=0.05），表明加糖可能会抵消这些代谢益处。
血糖中的过滤依赖性微生物通路
研究为”咖啡-肠道微生物群-代谢”轴提供了遗传证据，表明过滤过程至关重要，因为它去除了二萜类化合物，同时保留了绿原酸和多酚。这些化合物可能创造有利于韦荣球菌属（一种已知的丙酸生产者，可增强胰岛素敏感性）的抗氧化环境。然而，这些机制目前仍属推测，尚未经实验验证。
研究建议将无糖过滤咖啡作为改善血糖控制的简单饮食措施，但由于数据完全来自欧洲人群，其普遍适用性受到限制。